- Използване на енергия от организмите: Организмите използват енергия за различни процеси като метаболизъм, растеж и възпроизводство. Значително количество от енергията, получена от предишното трофично ниво, се използва за тези дейности, което води до загуба на енергия.
- Клетъчно дишане: Клетъчното дишане, процесът, чрез който организмите превръщат органичната материя в енергия, не е 100% ефективен. Част от енергията се губи като топлина по време на този процес.
- Непълно потребление: Не цялата биомаса на организъм на едно трофично ниво се консумира от организми на следващото трофично ниво. Някои части, като кости, козина и растителна целулоза, могат да останат неизядени или несмилаеми.
- Разлагане и дишане: Разлагащите вещества, като бактерии и гъбички, разграждат мъртвата органична материя, освобождавайки енергия под формата на топлина. Освен това микроорганизмите, участващи в разлагането, консумират малко енергия по време на собствените си дихателни процеси.
- Ограничения за пренос на енергия: Ефективността на енергийния трансфер между трофичните нива обикновено е около 10%. Това означава, че само 10% от наличната енергия на едно ниво се предава на следващото ниво. Останалите 90% се губят като топлина и други форми на неизползваема енергия.
Тези комбинирани фактори водят до постепенно намаляване на наличната енергия на всяко трофично ниво в хранителната верига. Колкото по-нагоре в хранителната верига е един организъм, толкова по-малко енергия има на разположение. Това ограничава дължината на хранителните вериги и броя на трофичните нива, които една екосистема може да поддържа.