Няколко фактора засягат разнообразието на пресноводните езера:
- Размер и дълбочина: По-големи и по-дълбоки езера общинно поддържат повече видове и хабитати.
- Качество на водата: Замърсяване, еутрофикация и седиментация намаляват биоръзнообразието.
- Сложност на хабитата: Растения, дървесина, камъни и остатъци създават микрохабитати за различни видове.
- Свързаност: Връзки с потоци или реки позволяват дисперсия на видове и увеличават богатството.
- Хищене и конкуренция: Тези взаимодействия оформят общностната структура.
- Абиотични фактори: Температура, pH, разтворен киселород и наличност на светлина влияят на оцеляването на видовете.
- Климат и география: Регионалните условия определят кои организми могат да процъфтяват.
- Инвазивни видове: Чужеродни видове могат да надминат местните и да намалят разнообразието.