От стомаха Chyme се премества в тънките черва, което е най -дългата и най -сложна част от храносмилателната система. Тук по -голямата част от поглъщането на хранителни вещества се извършва, тъй като химата се смесва с храносмилателни ензими, произведени от панкреаса, като амилаза, липаза и протеаза и жлъчка, произведена от черния дроб. Тези ензими разграждат сложни въглехидрати, мазнини и протеини в прости захари, мастни киселини и аминокиселини, съответно. Стените на тънките черва съдържат малки, подобни на пръсти проекции, наречени вили, които увеличават повърхността за усвояване на хранителни вещества.
Непоглъченият материал, оставен след усвояването на хранителни вещества, се премества в дебелото черво, което се състои от дебелото черво и ректума. Колонът абсорбира водата и електролитите, превръщайки останалата хима в твърди отпадъци. Ректумът съхранява твърдите отпадъци, докато не може да бъде елиминиран от тялото през ануса по време на процеса на дефекация.