Layers в водните екосистеми включват материала на дъното на водното тяло , най-често пясък , скали или калта. След това е самата вода , която може да бъде сладководни или соленоводни и статични или движещи се . Например една река тече , но блато е в застой и не се движи . Най-горният слой е въздуха над водата . Това е важно, защото игенати водата и химикали от въздуха се разтварят във водата и да повлияе на неговата яснота и качество. Наем Микроорганизми
Микроорганизмите са много малки форми на живот, които вие не може да види с невъоръжено око , освен в големи групи, като водорасли или гъбички . Те съществуват в големи количества в рамките на слоя на екосистемата . Макар че те могат да причинят заболяване , като дизентерия , в рамките на една екосистема, те са от решаващо значение , тъй като те се разлагат и рециклиране материал, за да се отстранят замърсяващите вещества . Ако рибата умира , например ще бъде токсичен за вода , ако не се разлага и се изхвърлят от микроорганизми . Микроорганизмите също осигуряват азот за регулиране на околната среда за оцеляването на други организми.