Прилепите имат висока скорост на метаболизма и изискват много кислород, за да захранват полета си. Те дишат по -бързо от другите бозайници, а белите им дробове са по -големи пропорционално на размера на тялото им. Прилепите също имат специална адаптация, наречена "носната клапа", която им помага да регулират своя въздушен поток по време на полет.
Когато вдишва прилеп, въздух навлиза през ноздрите си и преминава през носния клапан. Носният клапан помага да се контролира количеството въздух, който влиза в белите дробове, а също така не позволява на въздуха да се изтича обратно от носа по време на полет.
След това въздухът пътува по трахеята и в белите дробове. Белите дробове са облицовани с алвеоли, които са малки въздушни торбички, където се извършва обмен на газ. Кислородът от въздуха се дифундира в кръвта, а въглеродният диоксид се дифузира от кръвта във въздуха.
След това въздухът излиза от белите дробове и преминава през трахеята и извън ноздрите.
Прилепите са в състояние да дишат, докато летят благодарение на мощните си бели дробове и ефективната дихателна система. Те са в състояние да поддържат висока скорост на консумация на кислород дори по време на дълги и напрегнати полети.