Неживите компоненти на Борнео включват:
- Скали и минерали: древен шист и гнейс, плюс въглен, злато, мед и диаманти.
- Пещери: обширни вапненови системи като Мулу пещери, дом на Сауарак камара.
- Плажове и пясък: брегове по Южно-китайско, Сулу и Селебес море с вариращи видове пясък.
- Почва: разнопосочни почви от кисели турови до плодородни вулканични почви.
- Водни обекти: моря, коралови рифове, манглови и реки като Капуас и Раджанг.