Генетично разнообразие: Клонирането произвежда генетично идентични индивиди. Липсата на генетично разнообразие може да направи населението по-податливо на болести, промени в околната среда и други заплахи.
Поведенчески и екологични въздействия: Клонираните животни може да нямат естествено поведение, социални структури и екологични взаимодействия, развити през поколенията на еволюцията. Това може да наруши динамиката на екосистемата.
Конкуренция и използване на ресурсите: Въвеждането на клонирани индивиди може да увеличи конкуренцията за ресурси като храна, местообитания и партньори, засягайки други видове.
Предаване на болестта: Клонираните животни могат да носят болести или генетични дефекти, които могат да се разпространят сред дивите популации.
Пригодност за местообитание: Клонираните животни може да не са добре адаптирани към специфичните условия на техните естествени местообитания, което води до ниски нива на оцеляване.
Екосистемна функция: Липсата на екологичен принос на клонирани животни, като опрашване, разпръскване на семена или хищничество, може да промени функционирането на екосистемата.
Липса на естествен подбор: Клонирането заобикаля естествения подбор, което елиминира по-малко адаптирани индивиди. Това може да доведе до популация, която не е подходяща за околната среда.
Непредсказуеми дългосрочни ефекти: Дългосрочните екологични последици от клонирането и въвеждането на генетично идентични животни в една екосистема не са напълно разбрани.
Следователно, докато клонирането на застрашени видове може да изглежда като обещаващ инструмент за опазване, към него трябва да се подхожда предпазливо и е необходимо задълбочено изследване, за да се оценят неговите потенциални рискове и въздействия върху екосистемите.