Пристанищните морски свинки са относително големи и ловки, и нямат много естествени хищnici. Основните хищници на пристанищните морски свинки са:
- По-големи акул: Бели акул, сини акул и мако акул са известни да ловят пристанищни морски свинки.
- Орки (китове-убийци): Орките, като връхови хищници, са способни да ловят и убиват морски свинки, макар че това не е често срещано явление.
- Други морски бозайници: Възможно, други големи морски бозайници като тюлени или по-големи делфини могат да ловят млади или наранени морски свинки.
Важно е да се отбележи, че човешката дейност е голяма заплаха за пристанищните морски свинки, дори по-голяма от естествените хищници. Тези заплахи включват:
- Прилов: Случайно улавяне в риболовни мрежи.
- Замърсяване: Замърсяване от химикали, пластмас и шум може да навреди и убие морски свинки.
- Загуба на среда обитания: Брегово развитие и замърсяване могат да деградират техния хобитат и да затруднят оцеляването им.
Затова, макар че съществуват естествени хищници, човешката дейност представлява много по-голяма заплаха за оцеляването на пристанищните морски свинки.