Комодски дракони се размножават чрез полово спариване и асексуална партеногенеза. В размножителен сезон, мъжете конкурират за жени чрез доминантни дисплеи. Спариването включва мъж да хване женната за врата и да въведе хемипените си.
Жените могат също да произвеждат потомство без мъже чрез партеногенеза. След оплодотворяване, жената отлага до 25 яйца в гнездо нора или дупка в дърво. Яйцата инкубират около 8–9 месеца. Излюпените са самоизточливи и веднага започват да ловят насекоми и малки пресмыкащи се.
Жените могат да съхраняват сперма за по-късно използване, а излюпените имат специален яйчен зъб за пробиване на кора. Тези стратегии помагат на комодските дракони да оцелеят в техните островни екосистеми.