1. Черва: Salmonella се колонизира и възпроизвежда предимно в стомашно-чревния тракт, по-специално в червата. Бактериите могат да се размножават бързо в тънките черва, причинявайки възпаление и свързани симптоми като диария, коремна болка, треска и гадене.
2. Мезентериални лимфни възли: Като част от имунния отговор на организма, Salmonella може да нахлуе в мезентериалните лимфни възли, които се намират близо до червата. В тези лимфни възли бактериите могат да пролиферират и да причинят възпаление.
3. Черен дроб и далак: В тежки случаи, особено при инвазивна нетифозна салмонела (iNTS), бактериите могат да се разпространят през кръвния поток и да достигнат черния дроб и далака. Тук Salmonella може да се възпроизвежда в тъканите и клетките на Купфер на черния дроб и макрофагите на далака.
4. Жлъчен мехур: При индивиди със съпътстващи заболявания като камъни в жлъчката или жлъчни аномалии, Salmonella може да колонизира жлъчния мехур и да се размножава в жлъчката. Това може да доведе до възпаление на жлъчния мехур (холецистит).
5. Други сайтове: В редки случаи може да възникне дисеминирано заболяване, което позволява на Salmonella да се разпространи в други органи и тъкани извън стомашно-чревния тракт, като кръвообращението (бактериемия), костите, ставите, менингите и сърдечните клапи. Тогава може да възникне възпроизвеждане в тези заразени сайтове.