Основната причина за закисяване на водите е киселинният дъжд. Емисиите от фосилни горива – серен диоксид и азотни оксиди – реагират с киселород и водна пара, образувайки серниста и азотна киселина, които падат като дъжд, сняг или сухо наложение.
Киселинният дъжд попада директно в водните обекти и чрез površен отток от водосборните басейни, понижавайки pH. Променя химизма на почвата, изплаква минерали като калций и магнезий и освобождава водородни йони. Времето намалява естествената способност на водата да неутрализира киселини.
Закисяването вреди на водни растения, насекоми и риби, засягайки размножаване и Sobrevivencia. Влияе местната геология, растителност, валежи и антропогенна дейност.