Няколко човешки дейности са допринесли значително за застрашаване на чернопастата фретка:
1. Загуба на habitat
Основната причина за спада на популациите на чернопаста фретка е било унищожението на техните прерийни травестиобитания. Превръщането на тези земи за земеделие, урбанизация и ресурсно развитие е довело до значително намаляване на наличното habitat за прерийни песове и, следователно, за чернопасти фретки.
2. Отравяне
Правителствени програми за контрол на хищници, насочени към изкореняване на прерийни песове, често са включвали употреба на отрови, като стрихнин и цианид. Тези отрови са били прилагани в норите на прерийни песове и често са засегали не-целови видове като чернопастата фретка, водейки до намаляване на техните числа.
3. Болести
Силватична чума, болест, предизвикана от бактерия Yersinia pestis, е високо инфекциозна сред чернопасти фретки и е причинила сериозни популационни спада. Въпреки че е ендемична за някои райони на Северна Америка, болестта е била разпространена от европейски селители и техния добитък. Чувствителността на чернопастата фретка към чума е един от основните фактори, ограничаващи нейното възстановяване.
4. Лов и улавяне
Чернопастите фретки са били ловени и улавани в миналото, преимуществено заради техната козина. Това не е било значителен допринос за техното застрашаване, но е добавило към кумулативното въздействие на другите фактори.
5. Конкуренция и предиторство
Промени в прерийната екосистема, като спад на прерийни песове и навлизане накойоти, са засегнали чернопастите фретки. Койоти и домашни кучета ловят чернопасти фретки, докато намаляването на колонии на прерийни песове засяга наличността на подходящи нори, храна и укритие за фретките.
Направени са усилия за консервация и възстановяване на чернопастата фретка чрез програми за отглеждане в неволя, превъвеждане и инициативи за консервация на habitat. Въпреки това, заради продължаващите предизвикателства, поставени от загуба на habitat, болести и предиторство, видът остава критично изчезващ и уязвим на допълнителни популационни спада.