Загуба и фрагментация на местообитания: Унищожаването на местообитанията на лемурите поради обезлесяването, минното дело и разширяването на земеделието е една от най-големите заплахи, пред които са изправени тези примати. Тъй като техните местообитания се свиват и се фрагментират, лемурите имат по-малко пространство за бродене, намиране на храна и размножаване.
Лов и бракониерство: Лемурите се ловуват заради тяхното месо, козина и като домашни любимци. Тази незаконна дейност е особено вредна за застрашените видове лемури и може да доведе до тяхното местно изчезване.
Промяна на климата: Мадагаскар изпитва въздействието на изменението на климата, като повишаване на температурите и променени модели на валежите. Тези промени засягат местообитанията на лемурите и наличието на източници на храна, което затруднява оцеляването и размножаването им.
Въведени хищници: Въвеждането на неместни видове като котки, кучета и мангусти също има отрицателно въздействие върху популациите на лемури. Тези хищници могат да нападнат лемури, което води до повишена смъртност.
Заболяване: Лемурите също са податливи на болести, които могат да се предават от хора или други животни. Някои от тези заболявания могат да причинят сериозни заболявания и дори смърт сред популациите на лемури.
Справянето с тези заплахи и опазването на местообитанията на лемурите са от съществено значение за оцеляването на тези уникални примати и биоразнообразието на Мадагаскар. Усилията за опазване като защита на местообитанията, практики за устойчиво горско стопанство, борба с незаконния лов и търговия и повишаване на осведомеността са от решаващо значение за гарантиране на дългосрочното оцеляване на видовете лемури.