Пустинните мишки са опортунистични всеядни, ядейки каквото е налично.
Растителна храна
Семена, плодове, листа, корени и клубени са основни хранителни източници.
Животна храна
Насекоми, малки безгръбначни, птици яйца и ас може да бъдат изядени. Някои също консумират гъби и човешки хранени остатъци.
Конкретните диети варират според местоположението, сезона и наличността на храна.