Кафявите мечки са кафяви заради меланин, пигмент, който оцветява косmata, кожата и очите. Двата основни типа са еумаланин, който дава кафяво или черно, иpheомеланин, който дава рудещи или жълти тонове. Кафявите мечки имат по-висока концентрация на еумаланин.
Други фактори, влияещи на цвета, включят генетика, диета, възраст и слънчево излъчване. Диета, богата на ягоди, може да направи длътата по-рудещи, по-младите мечки могат да имат по-светла длътна, а слънцето може да осветли длътата с времето.
Въпреки че кафяво е най-често срещаният цвят, длъната на кафявите мечки може да варира от блонд до черен в зависимост от тези фактори.