Стоководното куче принадлежи на типът Chordata (Хордови). Хордовите са животни, които притежават нотохорд, гръбен нежен мъг и фарингиални кепки за време на ембрионалното развитие. Стоководните кучета, принадлежащи на род Canis, попадат в подтипа Vertebrata (Хребетни), защото имат гръбнак.