Повечето фосили са съставени от минерали като калцит, силиций или пирит. Тези минерали заместват оригиналния органичен материал през времето, когато организмите са закопани в наслай и са изложени на минерално-богато подземно вода. В други случаи, горещ вулканен пепел или лава могат да изпарят органичния материал и да оставят минерална отливка. Някои фосили са запазени в ям bol, катранови ямки или тъфови блата.