Ендоспорите могат да издържат на високи температури поради уникалния си състав. Външният слой на ендоспората, известен като екзоспориум, осигурява защита срещу тежки условия. Ядрото на ендоспората съдържа дехидратирана клетка и висока концентрация на дипиколинова киселина, което допринася за нейната устойчивост на топлина.
Въпреки че врящата вода може да убие повечето вегетативни бактерии (активно растящата и деляща се форма на бактерии) при 100 градуса по Целзий, тя може да не е достатъчна, за да убие ендоспорите. Тези спори могат да оцелеят при температури на кипене за продължителни периоди, вариращи от няколко минути до няколко часа. В някои случаи ендоспорите могат дори да оцелеят с години във вряща вода.
За ефективно унищожаване на ендоспорите са необходими по-високи температури и/или по-дълго време на експозиция. Пара под налягане в автоклав, който достига температури над 121 градуса по Целзий (250 градуса по Фаренхайт) и херметизиране за увеличаване на проникването на пара, обикновено се използва за гарантиране на унищожаването на ендоспорите. Този метод на стерилизация е от съществено значение в различни индустрии, включително хранителна, фармацевтична и медицинска.
Важно е да се отбележи, че кипенето на вода при 100 градуса по Целзий все още е решаваща стъпка в приготвянето на храната и хигиенизирането, тъй като може да убие много вредни бактерии и вегетативни клетки. Въпреки това, не трябва да се разчита само на него за елиминиране на ендоспори, особено в случаите, когато се изисква пълна стерилизация. Може да са необходими допълнителни мерки, като варене под налягане или автоклавиране, за да се гарантира разрушаването на тези еластични структури.