Алгичните цъфтевения могат драматично да променят екосистемата на езерце, засегайки организми на всеки ниво на хранителната верига.
Фитопланктон и зоопланктон
Цъфтевенията често включват експлозивен растеж на определени видове фитопланктон. Докато тези микроскопични алги формират основата на водната хранителна верига, излишният растеж създава дисбаланс. Популациите на зоопланктон могат първоначално да скочят в отговор на изобилната храна, но те могат да сразят, когато цъфтевението замине, оставяйки по-малко храна за видове по-високо в веригата.
Риби
Рибите, които разчитат на зоопланктон, могат да се сблъскат с недostatък на храна след спадане на цъфтевението, което може да засегне растежа, размножаването и общото здраве на популацията.
Бентосни организми
Гъсти повърхностни ковчези от алгични цъфтевения могат да блокират слънчевата светлина от да стигне до дъното на езерцето. Това ограничава фотосинтезата за бентосните растения, намалявайки храна и среда за обитване на дънообитаващи организми.
Липса на кислород
Когато алгите умират и се разлагат, бактериите консумират големи количества кислород. Това може да създаде хипоксични или аноксични условия, които стресират или убиват рибите и друг воден живот.
Колебания на pH
Интензивната днешна фотосинтеза може да повиши pH и да понижи нивата на въглероден диоксид. Нощно, дишането обръща процеса, задействайки pH да падне и CO2 да се качи. Тези колебания могат да нарушат метаболизма и дишането на другите жители на езерцето.
Токсини и алелопатия
Някои алгични видове произвеждат вредни токсини, които могат да наранят или убият риби, зоопланктон и друг воден живот. Други отделят алелопатични химикали, които инхибират растежа на съперничаващи организми, допълнително дестабилизирайки екосистемата.
Общо взето, алгичните цъфтевения нарушават деликатния баланс на езерщите екосистеми чрез промяна на хранителни вериги, изтощаване на кислород, въвеждане на токсини и заплаха за преживяването на разни водни организми.