Пухер-рибите са известни с своята токсичност, която отблъсква повечето хищnici. Въпреки това, няколко животни са развили начини да ги ядат.
Основни хищници включват:
* Акули: Определени видове, като тигрови акули, имат мощни челюсти и пробavni системи, способни да се справят с токсините на пухер-рибите.
* Делфини: Ограничени доклади предполагат, че делфините може да насочват пухер-риби, макар поведението да не е добре документирано.
* Морски калкули: Тези любопитни бозайници са наблюдавани да ядат пухер-риби, вероятно като внимателно избягват токсичните органи.
Вторични консуматори включват мръсоедци като раци, лобстери и донни същества, които може да се хранят с останки от пухер-риби след като други хищници са направили убийство или след като рибата е умирала естествено.
Важно е да се има предвид, че хищническите отношения варират според вида пухер-риба и региона, а директните наблюдения в природата са рядкости. Мощният невротоксин тетродотоксин държи повечето животни далеч, но няколко специализирани хищници са намерили начини да оминат тази защита.