Възрастните морски лъвове, особено по-големите самци, имат малко естествени хищници в дивата природа. Въпреки това, съществуват заплахи, особено за mladните и малките животни.
Хищници
Бели акули: Значителна заплаха, особено в зони, където ареалите им се прекрийват с морските лъвове.
Орки (убийци китове): Известни са с лов на морски лъвове, използвайки интелект и отборна работа.
Други акули: Мако и бик-акули извреме навреме атакуват морски лъвове.
Други заплахи
Хората: Рибарство, корабоплаване и замърсяване създават рискове.
Болезни: Морските лъвове са восприимчиви към заболявания, които ги ослабват и ги правят по-уязвими на хищниците.
Възрастните самци на морски лъвове са общо взето безопасни от повечето хищници поради размера и силата си. Младенците и младните морски лъвове са по-уязвими и често са цел на орки и акули.