Прилучен дъвчае
Основната заплаха за баиджи е случайното улавяне в риболовни мрежи. Увеличеният риболов в Янцзе е повишил вероятността за улавяне на индивиди в уреди, особено даден изчерпаният брой и ограниченият обсег на вида.
Деградация на habitat
Янцзе е една от най-замърсените реки в света. Замърсите като тежки метали, пестициди и фармацевтици могат да причинят рак, репродуктви проблеми и имунен дисфункция при делфини. Строежето на язовири и други водни проекти също са допринесли за деградация на habitat.
Лов
Въпреки че китайското правителство е забранило лова на баиджи делфини, нелегалният лов все още се случва. Делфини са ловени за месо, считано за деликатес в някои райони, и за масло, използвано в традиционната китайска медицина.
Кумулативните ефекти от тези заплахи причиниха бързо намаляване на популацията. В 1980-те г. се оцени, че 400 баиджи делфини живеят в Янцзе. Към късните 2000-те г. останаха само 18 индивида. През 2016 г. баиджи беше деклариран за функционално изчезнал, без потвърдени наблюдения от 2002 г.