Blue- зелени водорасли , първоначално трябва да бъде вдигнат физически от ръката . Синьо-зелени водорасли форми дебели рогозки върху аквариум субстрат , скали и декор. Скали и декор може лесно да се отстраняват и почистват . A трудно настръхна четка ще премахне cyanobactera от тези елементи , които след това трябва да се изплакват с течаща вода, преди да бъде върнат в аквариума. Blue- зелени водорасли може също палто филтърни тръби и електрически глави и тези елементи могат нормално да бъдат отстранени за почистване . Blue- зелени водорасли , обикновено е резистентен към ликвидиране и аквариста ще трябва да повторите процеса на почистване повече от веднъж. Наем смени на водата и източване
Blue- зелени водорасли изтривалки които покриват субстрата също могат да бъдат източени от аквариума. Процесът за източване премахва големи количества от цианобактерии и има допълнителното предимство, че позволява аквариста да замени старата вода, която е с високо съдържание на органични вещества , с прясна вода. Водата ще бъдат източени от аквариума заедно с подложките на синьо - зелени водорасли , и по този начин , метаболитни отпадъци в аквариумната вода се разрежда . Може да се наложи да повторите този процес на всеки два или три дни, докато цианобактериите е ликвидирана .