Според Международния съюз за опазване на природата (IUCN), някои видове морски коне се считат за уязвими за застрашени, като спадът на населението се наблюдава в много региони. Например, IUCN Red List класифицира следните видове като уязвими:
1. Хипокампус идва (подплатен морски кон):Намерен в Западния Тихи океан, този вид е застрашен от унищожаване на местообитания и свръх риболов.
2. Hippocampus trimaculatus (три място морски кон):Роден в Индо-Тихоокеанския регион, този морски кон е уязвим от загуба на местообитания и събиране на традиционната медицина.
3. Хипокампус хипокампус (бодлив морски кон):Разпространено в Средиземно море и Източния Атлантически океан, този вид е изправен пред заплахи от крайбрежно развитие и риболовен натиск.
4. Hippocampus erectus (морски кон от жираф):обитавайки тропическите води на Индо-Тихия океан, морската конна жираф е податлива на деградация и свръх риболов на местообитания.
Тези оценки подчертават необходимостта от усилия за опазване и устойчиви практики за управление за защита на населението на морските коне и гарантиране на тяхното оцеляване пред различни заплахи, с които се сблъскват.