Манатетът е уязвим вид поради няколко фактора, включително загуба на местообитания, лов и замърсяване на водата.
- Загуба на местообитание: Крайбрежното развитие, като изграждането на пристанища и морските стени, унищожава или фрагменти маниати на местообитания, което затруднява намирането на храна и подслон. Освен това, промените в качеството на водата поради замърсяването и човешките дейности могат да повлияят на растежа на леглата за морска трева, основния източник на хранителни стоки на Манате.
- Лов: В някои райони манатите все още се ловуват за месото си, въпреки международната и националната защита.
- замърсяване на водата: Манатите са отрицателно повлияни от излагането на токсични вещества и вредните цъфтежи на водорасли, могат да причинят заболяване и смърт, като нарушават дихателните си, храносмилателни, репродуктивни системи. Някои токсични вещества също могат да се натрупат в телесните тъкани на Манатес, които водят до дългосрочни хронични ефекти, включително имунни, ендокринни разрушения или дори генетични увреждания, което може да повлияе на тяхната преживяемост в морската среда