Лечението на ноктен гъбичен може да бъде строго и отнемащо време, защото инфекцията е бавнорастваща и устойчива на лекарства. Лечителните планове често продължават 12 седмици или повече и изискват търпение и последователност.
Могат да бъдат преписани перорални антимикотични лекарства за тежки случаи, докато локални третмани като лакове или кремове също се използват, макар че проникването през ноктената плоча може да бъде предизвикателство. Реинфекцията е честа, така че строга хигиена и превантивни мерки са съществени.
Пероралните лекарства могат да имат странични ефекти, включуквайки промени в черничните ензими, и продължаващото лечение често се препоръчва дори след изчезване на видимите симптоми, за да се предотврати рецидив. При тежки или сложни случаи може да бъде необходима помощ от дерматолог или подолог.