Въпреки че понастоящем не се счита за застрашено, населението им намалява поради няколко заплахи, включително:
* Загуба на местообитания и фрагментация: Обезлесяването и преобразуването на земята за селско стопанство и развитие свиват местообитанието им.
* Лов и бракониерство: Ягуарите се ловуват за козината си, частите на тялото, използвани в традиционната медицина, а понякога и от страх или отмъщение.
* Конфликт на човека-Wildlife: С нарастването на човешките популации има повече срещи между ягуари и хора, водещи до конфликти, а понякога и убийството на ягуари.
Важно е да се отбележи, че Jaguar популациите са силно променливи в техния обхват , с някои области, които имат много по -ниски числа от други. Някои популации са критично застрашени, което прави усилията за опазване от решаващо значение.