Мускусните еленчета се ловят предимно заради техния мускус, високоценна субстанция в парфюмерната индустрия. Мъжките мускусни еленчета произвеждат мускус за маркиране на територия и притягане на партньори. Неговият мощен, дълготраен аромат служи като фиксатив в парфумите, помагайки на другите аромати да се свързват и траят по-дълго.
Бракониерството за мускус представлява сериозна заплаха за популациите на мускусни еленчета. Този жесток и неустойчив практик нарушава екосистемите и е оттълкнал вида към застрашен или заплашен статус.
Освен мускус, мускусните еленчета се ловят и за месо и козина в някои региони, макар че тези натиска са общо взето по-малко разпространени от търсенето на мускус.