По-голямата част от диетата на пигмей мармозетка е съставена на ексудати ( на SAP и венеца) на горските насаждения и дървета. Малките мармозетки използват своите остри зъби и силни челюсти за сондажи в дърветата и смучат на течностите вътре . Малките мармозетки имат увеличена част на храносмилателния тракт , наречена цекума . Това помага за тяхното разграждане на венеца от лозови насаждения и дървета , като позволява повече време за процеса на храносмилането .
Насекоми
обаче е направена по-голямата част от диетата на пигмей мармозетка е съставен от дървесен сок , той също яде насекоми намерени в неговата тропически местообитание като скакалци и паяци .