Мини шнаузерите са перки, верни кучета, които са любими в много домове. техния малък размер ги прави лесни за поддържане, но тези кучета идват с някои недостатъци. техните дълги, пухкави коса изискват последователно грижа, и като всяко куче, те могат да станат жертва на някои болести, с сериозни последствия.
Червеи
Всички кучета са изложени на блъсти и паразити като бълхи, които пък могат да ги изложат на допълнителни паразити като лентични червеи. Лентичните червеи влизат в пробавния тракт на миниатюрния шнаузер, се закачат за стените на червата и се хранят с преминаващата храна. Тези паразити се размножават асексуално и могат да растат до 1.5 метра дължина. Защото поглъщат храната на мини шнаузера, лентичните червеи причиняват загуба на тегло при кучетата. Чрез нарушаване на пробавната система, лентичните червеи също причиняват диарея и ровене. Те са лечими с антихеelmинтични лекарства.
Бобрешна болест
Миниатюрните шнаузери са особено предразположени към камени в бобрезите и бобрешна болест. При бобрешна болест, бобрезите на миниатюрния шнаузер спрат да функционират нормално. Вместо да филтрират токсините и излишната течност в мехура, дефектните бобрези пускат токсините обратно в кръвта. Кучетата започват да пият повече, за да опитат да филтрират кръвта си, което причинява увеличено уриниране. Миниатюрният шнаузер става неспособен да взема храна от храната, което резултира в диарея. Ровенето е един от последните симптоми на бобрешна болест, която е нелечима.
Диабет
Мини шнаузерите също са предразположени към диабет, заедно с редица симптоми. Диабетът е метаболично разстройство, при което тялото на миниатюрния шнаузер е неспособно да използва инсулина за прехранване на хранителните вещества до клетките. Това е изтощаваща болест; мини шнаузерът буквално е неспособен да обработва никаква храна. Диабетна кетоацидоза (ДКА) е осложнение на диабета, при който червеят на миниатюрния шнаузер надпроизвежда кетокиселини, които водят до електролитни дисбаланси и дехидратация. Самият диабет причинява изтощване, диарея и ровене, поради липсата на храна в тялото. Тези симптоми стават по-изразени, когато миниатюрният шнаузер има ДКА като осложнение на диабета.