Кафява пеликан е екологично ценен по няколко начина:
Екологична роля: Те се хранят с риби, помагайки за поддържане на балансирани хищник-добив отношения в морски екосистеми.
Индикатори за популация: Като върхови хищници, техните здраве и популационни тенденции разкриват информация за благополучието на морската среда.
Падальници: Те могат да ядат мъртви риби, помагайки за премахване на органни вещества от водите.
Хранителен цикъл: Чрез хранене и изхлаждане, те разпръскват хранители вещества, подкрепяйки растеж на фитопланктон.
Индикатори за биоразнообразие: Техното присъствие и здраве отразява разнообразието на други морски видове.
Културно значение: Те са символи на брежни екосистеми во много региони.
Естетика: Техният величествен полет и пикиране за лов добавят природна красота на брежните среди.