- colugo :Известни също като летящи лемури, тези бозайници се плъзгат във въздуха, използвайки патагий, мембрана, която се простира между крайниците им. Филипинските орли са насочени към Колугос като основна част от диетата си.
- гигантски летяща катеричка :Тези големи катерици са арбореални, живеещи в дървета. Те служат като друг хранителен източник за филипински орли.
- Филипински макак :Този тип маймуни е родом от Филипините и прекарва голяма част от времето си в дърветата, което ги прави уязвими за хищничество от филипински орли.
- Други бозайници :Филипинските орли също от време на време могат да ловуват плъхове, прилепи и други малки бозайници, които обитават горите.
Заслужава да се отбележи, че филипинските орли са Apex хищници, което означава, че са в горната част на хранителната верига и нямат естествени хищници. Тяхната ловна мъдрост и мощните талони им позволяват да улавят и убият плячката си ефективно, което ги прави една от най -страхотните хищни птици в света.