Трилобити: Тези изчезнали морски членестоноги са широко разпространени в Пиренеите. Те процъфтяват през палеозойската ера, от камбрийския период до девонския период. Трилобитни вкаменелости могат да бъдат намерени на много места, като камбрийските шисти близо до Гаварни във Франция и във варовиците от Ордовик в района на Валибиерна в Испания.
Амонити: Амонитите са изчезнали главоноги, свързани със съвременните калмари и сепия. Те са често срещани в мезозойските скали на Пиренеите, особено в периодите Юра и Креда. Фосилизирани амонити могат да се наблюдават във варовика и мергелите на места като Col de Ares във Франция и Sierra del Montsec в Испания.
Ехиноиди (морски таралеж): Ехиноидите са морски безгръбначни с бодливи черупки. Техните вкаменелости са широко разпространени в Пиренеите от палеозоя до терциера. Те могат да бъдат намерени в плитки морски отлагания като варовиците от креда в района на Ронкал в Испания.
Rudist двучерупчести: Двучерупчестите рудисти са били изобилни през периода късна креда. Те са големи и често с причудлива форма, образувайки рифови структури в някои райони на Пиренеите. Фосилизирани рудисти могат да се наблюдават на места като дефилето Gavarnie и района на Luz-Saint-Sauveur във Франция, както и в националния парк Ordesa и Monte Perdido в Испания.
Nummulites: Нумулитите са изчезнали едноклетъчни фораминифери, които са живели в топли, плитки морета. Вкаменелостите от нумулит са често срещани в еоценските варовици в Пиренейския регион, особено в района на Хечо в Испания и района около По и Молеон във Франция.
Олигоценски бозайници: Пиренеите също са дали важни вкаменелости от бозайници от епохата на олигоцена, като останките от ранни примати, гризачи и месоядни животни, предоставяйки представа за ранната еволюция на тези групи.
Това са само няколко примера от разнообразните вкаменелости, открити в Пиренеите. Сложната геоложка история и условията на околната среда на планинската верига са довели до богато и важно палеонтологично наследство, което продължава да привлича учени и изследователи от цял свят.