1. Храносмилателни отпадъци: След като костенурките погълнат и усвоят храната си, несмлен материал се натрупва в червата им.
2. Образуване на изпражнения: Червата абсорбират вода и хранителни вещества от храната, втвърдявайки останалите отпадъци в изпражненията.
3. Съхранение в ректума: Образуваните изпражнения се съхраняват временно в ректума, който е последният отдел на дебелото черво.
4. Екреция: Когато ректумът се напълни или на равни интервали, костенурката изхвърля изпражненията през клоаката.
5. Уринарна екскреция: В допълнение към изпражненията, костенурките отделят азотни отпадъчни продукти, предимно под формата на пикочна киселина, през клоаката. Бъбреците филтрират отпадъците от кръвния поток, а уретерите транспортират урината до клоаката за елиминиране.
6. Съхранение на пикочния мехур (някои костенурки): Някои видове костенурки имат пикочен мехур, който съхранява урината, преди да бъде изхвърлена през клоаката.
Струва си да се отбележи, че честотата на отделяне може да варира при различните видове костенурки и може да бъде повлияна от фактори като диета, условия на околната среда и индивидуално здраве.