Пустынският кагаруов плъх се сблъсква с разнообразие от хищници, включително:
Бозайници
* Койотии, рисове, бразди, лисици: Опортونيстични хищници, които могат да уловят кагаруовите плъхове.
* Змееушители (Rattlesnakes): Могат да изненадат кагаруовите плъхове, макар че по-рядко.
Птици
* Норищни сови, големи рогови сови, пътеки (roadrunners): Въздушни хищници, които лесно могат да уловят кагаруовите плъхове.
* Змии: Различни змии, като лентични змии и бичеви змии, могат да ловят тях.
Адаптации за защита от хищничество
Пустынските кагаруови плъхове са нощни, живеят в норища, имат силни задни крачета за скокане и притежават отличен слух и мириз за откриване на хищници. Въпреки тези адаптации, те остават уязвими.