Белоухата джобна мишка е застрашена от инвазивни видове като червената внесена огнена мравка и дивото прасе. Огнените мравки могат да убият или наранят джобни мишки директно, като ги атакуват и отровят. Те могат също така да консумират семена и насекоми, на които джобните мишки разчитат за храна. Дивите прасета могат да се конкурират с джобни мишки за храна и подслон и да унищожат местообитанието им, като копаят и се валят.
Загуба на местообитание
Белоухата джобна мишка губи своето местообитание поради няколко фактора, включително градско развитие, селско стопанство и минно дело. Тъй като човешките популации нарастват и развиват нови райони, местообитанието, достъпно за белоухите джобни мишки, намалява. Селското стопанство може също така да превърне тревните площи и други местообитания, важни за джобните мишки, в обработваема земя или пасище. Добивът може също да повреди или унищожи местообитанието на джобната мишка чрез създаване на ями, пътища и друга инфраструктура.
Промяна на климата
Изменението на климата и свързаните с него промени в метеорологичните условия оказват значително влияние върху местообитанието и оцеляването на белоухата джобна мишка. Променливите метеорологични модели са нарушили репродуктивните цикли на мишката, което води до намаляване на популацията. Повишаването на температурите и екстремните метеорологични явления като суша и бури също водят до загуба на жизненоважни местообитания и източници на храна за белоухата джобна мишка.
Болест
Болести като хантавирус и чума представляват допълнителна заплаха за белоухата джобна мишка. Тези заболявания се пренасят от гризачи и могат да се разпространят в джобни мишки, което води до намаляване на популацията. Разпространението на болестта се улеснява от фрагментирането на местообитанията, което води до по-близък контакт между различните видове гризачи и увеличава предаването на тези смъртоносни патогени.
Свръхпаша от добитък
Прекомерната паша от добитък може значително да промени растителния състав и структурата на тревните площи, основното местообитание на белоухата джобна мишка. Това разграждане намалява наличието на храна и покритие за мишката, което я прави по-уязвима за хищници и оказва влияние върху нейния репродуктивен успех.
Тези фактори, съчетани с ограничения географски обхват на белоухата джобна мишка и ниската гъстота на популацията, са довели до класифицирането ѝ като застрашен вид. Усилията за опазване, насочени към защита и възстановяване на местообитанието му, контролиране на инвазивните видове, смекчаване на ефектите от изменението на климата и предотвратяване на разпространението на болести, са от съществено значение за гарантиране на оцеляването на белоухата джобна мишка.