Храносмилателната им система обаче е уникална по няколко начина:
* Те са тревопасни: Храносмилателната им система е проектирана да разгражда растителната материя, която е по -трудна за усвояване от месото.
* Те имат голям цекум: Тази торбичка в храносмилателния тракт има бактерии, които помагат за усвояване на целулозата в растенията.
* Те практикуват "cecotrophy": Те ядат собствените си меки, богати на хранителни вещества изхвърляния, което им позволява да абсорбират повече хранителни вещества от храната си.
Така че, докато морските свинчета имат само един стомах, храносмилателната им система е доста завладяваща и сложна.