Рефугиумът е аквариумна среда, споделяща вода с основния бак, но недостъпна за неговите обитатели. Обикновено е отделен бак, свързан към същата филтрационна и циркулационна система. Повечето жив сток в рефугиума са микрофауна.
Жива скала и пясък
Основата на соления рефугиум. Съдържат безброй микроскопични и почти микроскопични организми, даващи биологична филтрация и балансирана екосистема.
Слънчогледи и червеи
Малки слънчогледи и червеи се хранят с водорасли, други организми и детрит в рефугиума. Транспортират и трансформират детрита → по-стабилна среда.
Ракообразни
Ако използвате рефугиума за отглеждане на фуражи за рибите – много избори. Артемия (fairy shrimp, sea monkeys) се ядат с лъкостраст, също копеподи и изоподи.
Ехинодерми
Различни много малки морски звезди процъфтяват в рефугиум. Добро място и за деликатни организми – късодъргали звезди (brittle stars) и морски краставици, далеч от големи агресивни риби.
Растения
В пресноводни системи рефугиумът защитава растящи растения от риби. Като при соления – може да пази по-малки/деликатни животни (излюпени малки) от гладни големи.
Карантин
Рефугиумът може да даде безопасно, временно убежище за болесни/наранени животни от основния аквариум.