Изобщо не се препоръчва използването на препарат за почистване на водорасли. Ако резервоарът се почиства редовно и има минимални петна от водорасли в него, ръчното почистване на петна с четка за зъби или стъргало за водорасли е ефективен начин за премахване на петната. Ако резервоарът има много петна от водорасли поради рядкост между почистванията, помислете за увеличаване на честотата на почистване на резервоара.
Препаратите за почистване на водорасли могат да бъдат вредни за рибите и другите обитатели на аквариума, както и за полезните бактерии, които живеят във филтъра. Ако водораслите се превърнат в проблем, най-добре е да се опитате да ги премахнете, като намалите количеството светлина, което резервоарът получава, увеличите циркулацията на водата и/или добавите малко водораслоядни риби или безгръбначни.