Замърсяване: Замърсяването, включително петролни разливи, изхвърляне от канализация, дъждовна вода и селскостопански отток, може да задуши кораловите рифове, блокирайки слънчевата светлина и предотвратявайки растежа на коралите. Химикалите могат да отровят морския живот и могат да имат отрицателно въздействие върху растежа на коралите и репродуктивния успех на рибите. Оттичането на торове и пестициди, използвани в селското стопанство, може да доведе до цъфтеж на водорасли, който задушава кораловите рифове и дисбалансира екосистемата на хранителната верига.
Промяна на климата: Повишаващите се температури на океана поради глобалното затопляне могат да избелят и убият коралите, а екстремните метеорологични явления, като урагани и тайфуни, могат да унищожат кораловите рифове. Подкисляването, което е понижаването на нивото на pH в океана поради абсорбирането на въглероден диоксид, също е заплаха за кораловите рифове. Подкисляването на океана затруднява изграждането и поддържането на скелетите на коралите, което може да доведе до колапс на кораловите рифове.
Прекомерен риболов може да наруши хранителната верига и да намали броя на хищниците, които контролират популацията на тревопасните животни. Това може да доведе до увеличаване на броя на тревопасните животни, които могат да увредят рифа, като пасат корали. Прекомерният улов може също да доведе до директно улавяне на риба жаба като източник на храна.
Прилов: Рибите жаби могат да бъдат уловени неволно в риболовни мрежи и траулери, което може да доведе до смъртта им.
Туризъм: Неконтролираният туризъм може да доведе до утъпкването на кораловите рифове и унищожаването на местообитанията на рибите жаби. Гмуркачите и гмуркачите с шнорхел също могат да хвърлят котви на коралови рифове, което може да ги повреди.