Основната причина инкубаторът да има нужда от вода е за поддържане на влажност. Влажността предотвратява изсушаване на яйцата, облекчава газообмена през раковината и помага за регулиране на температурата, защото водата държи топлина добре.
Повечето инкубатори имат воден резервоар на дъното. Когато водата изпарява, тя създава влажна среда. Венталтори могат да циркулират въздуха за равномерно разпределение на влажността.