Изчистването на местообитанията, от друга страна, е пълното премахване на местообитание, обикновено с цел преобразуване на земята в друга употреба, като селско стопанство или развитие. Докато фрагментацията на местообитанията може да възникне в резултат на изчистване на местообитанията, двата термина не са синоними.
Фрагментацията на местообитанията може да има редица отрицателни ефекти върху биоразнообразието и функцията на екосистемата. Например, той може да намали количеството на наличното местообитание за видове, което може да доведе до намаляване на популацията. Той също може да увеличи риска от инбридинг и други генетични проблеми. Освен това фрагментацията на местообитанията може да наруши движението на видовете и да им попречи да имат достъп до важни ресурси, като храна, вода и приятели.
Фрагментацията на местообитанията също може да има редица отрицателни ефекти върху функцията на екосистемата. Например, това може да доведе до промени в състава на растителни и животински общности, които могат да нарушат хранителната верига и други екологични взаимодействия. Той също може да увеличи риска от ерозия и други форми на деградация на околната среда.
Изчистването на местообитанията е основна причина за фрагментация на местообитанията, но не е единствената. Други човешки дейности, които могат да доведат до фрагментиране на местообитанията, включват минното дело, строителството на пътища и замърсяването.
Фрагментацията на местообитанията е сериозна заплаха за биоразнообразието и функцията на екосистемата. Важно е да предприемете стъпки за смекчаване на неговите ефекти, като защитите съществуващото местообитание и възстановяването на фрагментираното местообитание.