Характеристиките на карликонски миниатюрни коне варират от леки до тежки и са класифицирани в три основни типа. Разводчиците или собствениците на миниатюрни коне трябва да се обучават за характеристиките на карликонството при миниатюрните коне, за да се опитат да елиминират шанса за producиране на карлик. Въпреки че някои карликонски миниатюрни коне живяват нормален живот, повечето не и изискват години специална ветеринарна грижа. Всеки миниатюрен кон, показващ карликонски характеристики, трябва да бъде изключен от разводния пул.
Ахондроплазийни карлици
Ахондроплазичните (дословно „без хрящово формиране“) карликонски миниатюрни са най-малко физически засегнати от различните типове карлици. Този тип е охарактеризиран с накратени крака с по-голяма от нормалната глава. Тези миниатюрни изглеждат подобно на такса с техните дълги гърбове и къси дебели крака. Този тип също показва недостатъци на крака като сикл хокс, кау хокс или тоуинг аут. Ахондроплазичните карлици тендират да живеят по-нормален живот и не показват сериозните физически проблеми на другите типове карлици. Нещодашно изследване за карликонство при миниатюрни коне, извършено от експерта Джон Еберт и представено на ramblinroseranch.com, твърди, че жеребче с ахондроплазични черти „абсолютно трябва да има всеки копие на гена и от двата родители“.
Диастрофични карлици
Диастрофичните (дословно „изкривени“) миниатюрни конски карлици имат по-тежка форма на карликонство от ахондроплазичните карлици. Тези карлици показват деформации на гърба като кокар або изкривен гръб. Главите са наднадрупени с избухнал чело и много краток врат. Често главата измерва по-дълго от врата. Сериозни деформации на крака също са бележки с крака, които изглеждат изкривени. Този тип миниатюрен конски карлик може също да има хронични синусни проблеми. Чест проблем при диастрофичните миниатюрни конски карлици е вдишване на храна в синусите, което на свой ред причинява хроничен синусит.
Брахиоцефалични карлици
Основната характеристика на брахиоцефаличен (дословно „кратка глава“) миниатюрен конски карлик е изключително наднадрупена глава с избухнал чело. Ноздрите изглеждат деформирани и нагоре насочени. Главата може да бъде толкова деформирана, че изглежда смачкана. Много недостатъци на крака също се проявяват като сикл хокс. Тези карлици също имат много проблеми с синусити и могат да показват сериозен андербайт или „маيمونска уста“, което им затруднява дъвкане на сено и фураж. И брахиоцефаличните, и диастрофичните миниатюрни конски карлици могат да показват наднадрупени полови органи. Защото техните вътрешни органи са с един и същ размер като при нормален миниатюрен кон, карлиците тендират да имат много големи избухнали коремчета.
Минимално изразени миниатюрни конски карлици
През последните години има много контролверсия около термина „минимално изразен“ карликонски миниатюрни коне. Много разводчици използват този термин, за да опишат миниатюрен кон, който има по-субтилни характеристики на карликонство, като изпъкнало чело или краток врат, без другите видими знаци на карликонство. Много разводчици мислят, че тези по-субтилни знаци означават, че конът носи гена за карликонство, дори ако не е пълно изразен визуално. Джон Еберт не се съгласява с тази теория, кавайки, че често това са просто знаци на лошо конформиран миниатюрен кон, който нещо не е свързано с карликонство.