Хищници: Голям хищници като ягуари и анаконди ловят млади крокодили.
Хора: Ловят крокодили за кожа, месо и яйца; някои видове атакуват хора, влизащи в техната територия.
Болезни: Бактериални, вирусни и паразитарни инфекции могат да бъдат фатални или да причинят дългосрочни здравословни проблеми.
Загуба на живина: Строителство и замърсяване унищожават живините на крокодилите.
Климатични промени: Повишаване на нивото на морето може да завали гнездата, докато промените в температурата и валежите засягат наличността на храна и вода.