Ягуарите населяват джунгли, гори, храстовидникове и савани по Централна и Южна Америка, включително Амазонския дъждлив гора, Пантаналските влажни низини, Гран Чако, Андейски облачни гори и бразилските брегови манглови. Те предпочитат гъста растителност, която предоставя покрив за засада на добыв. Территорията на всеки ягуар може да варира от 25 до 100 квадратни километра.
Загубата на жилище от изрубяване, земеделие и човешки селища е една от най-големите заплахи за ягуарите. Консервационните усилия се фокусират върху защитени зони, устойчиво земеползване и общностно образование.