Да. Пигмейският слон е критично застрашен според IUCN. Опазвани усилия включват програми за размножаване в неволя, защита и възстановяване на биотоп, научни изследвания и мониторинг, анти-браконьерски патрули, задейване на общността и рефорестация. Тези действия целят да осигурят дългосрочно přeживяване на вида в Борнео.