Прилепите обикновено имат мускулна, земна миризма, произведена от химикали от кожата, длъбата и слюната им. Тези миризми помагат за комуникация, маркиране на територия и съвлюбване. Миризмът може да бъде силен в пещери, където големи колонии настаняват. Някои го считат за неприятен, други за неутрален или дори утешителен.