Койотите са опортунистични хищници и падальедци, но те са и добыв за по-големи животни. Ето някои от основните хищници на койотите:
По-големи хищници:
* Вълци: Вълците са основният естествен хищник на койотите, особено в райони, където техните ареали се прекриват.
* Планински лъвове: Планински лъвове, познати и като пуми, са мощни хищници, които могат да ловят койоти, особено в планински райони.
* Мечки: Въпреки че не толкова често, мечките също могат да ловят койоти, особено в райони, където са изобилни.
Други хищници:
* Риси: Рисите са по-малки от койотите, но все пак могат да ловят койоти, особено ювенилни или ослабени индивиди.
* По-големи хищни птици: Орли, сови и ястреби понякога могат да ловят койоти, особено младите.
* Други койоти: Конкуренцията може да бъде интензивна между койотски ята, и те могат да се убиват помежду си, особено за територия или ресурси.
Други заплахи:
* Човешка дейност: Човешката дейност като лов, капане и загуба на биотоп могат значително да засегнат популациите на койоти.
* Болести и паразити: Койотите могат да бъдат уязвими за болести и паразити, които могат да ги ослабят и да ги направят по-уязвими за хищници.
Важно е да се отбележи, че вероятността койот да бъде изяден от конкретен хищник варира значително в зависимост от фактори като локация, наличност на добыв и плътност на популацията на хищника.