Въпреки това, тъй като повече европейци започнаха да посещават Мавриций и околните острови, населението на Додо започна да намалява. Към средата на 17 век Додо е изчезнал.
Изчезването на Додо се дължи до голяма степен на човешката дейност. Холандските заселници, пристигнали на Мавриций през 16 век, въвеждат прасета, кучета и котки на острова. Тези животни преследват яйцата и младите на Додо и също се състезаваха с Додо за храна. В допълнение, холандските моряци често ловуваха Додо за храна и за перата си.
По времето, когато учените започнаха да изучават додото, той вече беше изчезнал. В резултат на това те трябваше да разчитат на сметките на ранните европейски изследователи и на няколкото оцелели екземпляри от Dodo Defer and Bones. Тези екземпляри не бяха много информативни и учените бяха оставени с много ограничено разбиране на додото.
В края на 20 век екип от учени, ръководени от д -р Джулиан Хюм, започнаха ново проучване на Додото. Те използваха различни техники, включително компютърно моделиране и ДНК анализ, за да реконструират външния вид и поведението на Додо. Техните изследвания разкриха, че додото е много по -сложна и интересна птица, отколкото се смяташе досега.
Додото сега се счита за икона на изчезване. Това е напомняне за крехкостта на екосистемите на нашата планета и за значението на защитата на застрашените видове.