Основната причина за застрашения статут на вълнестата паякообразна маймуна е загубата на местообитание. Местообитанието на вълнестата паякообразна маймуна се разчиства за различни цели, включително дърводобив, селско стопанство и заселване на хора. Това кара вълнестата маймуна да губи своето местообитание и способността си да намира храна и подслон.
Лов и бракониерство
Вълнестите паякообразни маймуни също се ловуват заради месото и козината си. Това е голяма заплаха за оцеляването им, тъй като намалява размера на популацията и възпрепятства размножаването на вида.
Промяна на климата
Изменението на климата също е заплаха за вълнестата паякообразна маймуна. С промяната на климата местообитанието на паякообразната маймуна става все по-малко подходящо за нейното оцеляване. Това кара паякообразната маймуна да се премести в нови райони, където може да не е толкова добре адаптирана и където може да бъде изправена пред нови заплахи.